da concordare tramite e-mail stefania.vai@unifi.it
CV
Laureata con lode in Scienze per la Natura e per l’Ambiente (laurea di primo livello, Facoltà di SS.MM.FF.NN) presso l’Università degli Studi di Camerino e in Scienze Preistoriche (laurea specialistica, Facoltà di SS.MM.FF.NN) presso l’Università degli Studi di Ferrara, ha conseguito nel 2011 il Dottorato di Ricerca in Scienze Antropologiche (XXIII ciclo) presso l’Università degli Studi di Firenze con tesi dal titolo “Analisi genetica diacronica e sincronica di antiche popolazioni piemontesi”. Dal 2012 al 2017 è stata titolare di assegni di ricerca presso il Dipartimento di Biologia Evoluzionistica dell’Università di Firenze dove, attualmente ricercatore, si occupa di analisi di DNA degradato da reperti antichi, principalmente umani, e forensi attraverso tecniche di antropologia molecolare tradizionali (PCR) e di nuova generazione (Next Generation Sequencing – NGS). La sua attività di ricerca riguarda principalmente l’evoluzione umana, dallo studio della variabilità genetica in Homo neandertalensis alle dinamiche popolazionistiche che hanno interessato Homo sapiens dal Paleolitico fino ad epoche recenti, ai processi di domesticazione di animali e piante, e studi in ambito forense. Le sue competenze, sviluppate nel corso degli anni di studio e ricerca nel campo dell’antropologia molecolare svolti in Italia e tramite collaborazioni internazionali con periodi di tirocinio all’estero, riguardano l’applicazione e lo sviluppo delle tecnologie di caratterizzazione del DNA estratto da campioni antichi e degradati di diversa origine (umana, animale, vegetale) e natura (ossa, denti, capelli, peli, tessuti molli mummificati, semi, fibre vegetali, coproliti). In particolare, le sue competenze riguardano, oltre le metodologie classiche basate su amplificazione tramite PCR e clonaggio genico, anche le metodiche NGS e di target enrichment ed i relativi protocolli specifici per l’analisi del DNA degradato, nonché le procedure bioinformatiche volte all’analisi di dati di sequenza NGS e alla valutazione del grado di degradazione ed eventuale contaminazione del materiale genetico, fino ad analisi di filogenesi e genetica di popolazione. La sua formazione che ha incluso periodi di tirocinio in campagne di scavo archeologico le ha conferito inoltre competenza nel recupero e contestualizzazione del materiale biologico antico che può essere oggetto di analisi molecolari. Ha preso parte a progetti di ricerca cofinanziati dal MIUR (PRIN, FIRB) ed internazionali volti ad approfondire la storia genetica ed evolutiva delle popolazioni umane. È revisore per riviste scientifiche internazionali. E’ co-autrice di diversi articoli pubblicati su riviste scientifiche internazionali.
Pubblicazioni
Modi A, Pisaneschi L, Zaro V, Vai S, Vergata C, Casalone E, Caramelli D, Moggi-Cecchi J, Mariotti Lippi M, Lari M. Combined methodologies for gaining much information from ancient dental calculus: testing experimental strategies for simultaneously analysing DNA and food residues. Archaeological and Anthropological Sciences 2020 12,10.
Vai S, Sarno S, Lari M, Luiselli D, Manzi G, Gallinaro M, Mataich S, Hübner A, Modi A, Pilli E, Tafuri MA, Caramelli D, di Lernia S. Ancestral mitochondrial N lineage grom the Neolithic “green” Sahara. Scientific Reports 2019 9(1),3530.
Modi A., Nesheva D., Sarno S., Vai S., Karachanak-Yankova, S., Luiselli D., Pilli E., Lari M., Vergata C., Yordanov Y., Dimitrova D., Kalcev P., Staneva R., Antonova O., Hadjidekova S., Galabov A., Toncheva D., Caramelli D. Ancient human mitochondrial genomes from Bronze Age Bulgaria: new insights into the genetic history of Thracians. Scientific Reports 2019 9(1),5412.
Vai S*, Brunelli A*, Modi M*, Tassi F, Vergata C, Pilli E, Lari M, Susca RR, Giostra C, Pejrani Baricco L, Bedini E, Koncz I, Vida T, Mende BG, Winger D, Loskotová Z, Veeramah K, Geary P, Barbujani G, Caramelli D, Ghirotto S. A genetic perspective on Lombard migrations. European Journal of Human Genetics 2019 27(4), pp.647-656. *these authors contributed equally to this work.
Amorim CEG1*, Vai S,*, Posth C*, Modi A, Koncz I, Bobo D, Hakenbeck S, Larocca MC, Mende B, Pohl W, Pejrani Baricco L, Bedini E, Giostra C, Francalacci P, Vida V, Winger D, von Freeden U, Ghirotto S, Lari M, Barbujani G, Krause J✝, Caramelli D✝, Geary PJ✝, Veeramah KR✝. Understanding 6th-century barbarian social organization and migration through paleogenomics. Nature Communications 2018 9(1),3547. *These authors contributed equally to this work.
Leonardi M, Sandionigi A, Conzato A, Vai S, Lari M, Tassi F, Ghirotto S, Caramelli D, Barbujani G. The female ancestor’s tale: Long-term matrilineal continuity in a nonisolated region of Tuscany. American Journal of Physical Anthropology 2018 167(3),pp. 497-506.
Mathieson I, Roodenberg SA, Posth C, Szécsényi-Nagy A, Rohland N, Mallick S, Olalde I, Broomandkhoshbacht N, Candilio F, Cheronet O, Fernandes D, Ferry M, Gamarra B, González Fortes G, Haak W, Harney E, Jones E, Keating D, Krause-Kyora B, Kucukkalipci I, Michel M, Mittnik A, Nägele K, Novak M, Oppenheimer J, Patterson N, Pfrengle S , Sirak K, Stewardson K, Vai S, Alexandrov S, Alt KW, Andreescu R, Antonovic D, Ash A , Atanassova N, Bacvarov K, Mende BG, Bocherens H, Bolus M, Boroneant A, Boyadzhiev Y, Budnik A, Burmaz J, Chohadzhiev S, Conard NJ, Cottiaux R, Cuka M, Cupillard C, Drucker DG, Elenski N, Francken M, Galabova B, Ganetovski G, Gély B, Hajdu T, Handzhyiska V, Harvati K, Higham T, Iliev S, Jankovic I, Karavanic I, Kennett DJ, Komšo D, Kozak A, Labuda D, Lari M, Lazar C, Leppek M, Leshtakov K, Lo Vetro D, Los D, Lozanov I, Malina M, Martini F, McSweeney K, Meller H, Mirea P, Moiseyev V, Petrova V, Price TD, Simalcsik A, Sineo L, Šlaus M, Slavchev V, Stanev P, Starovic A, Szeniczey T, Talamo S, Teschler-Nicola M, Thevenet C, Valchev I, Valentin F, Vasilyev S, Veljanovska F, Venelinova S, Veselovskaya E, Viola B, Virag C, Zaninovic J, Zäuner S , Stockhammer PW, Catalano G, Krauß R, Caramelli D, Zarina G, Gaydarska B , Lillie M, Nikitin AG, Potekhina I, Papathanasiou A , Boric D, Bonsall C, Krause J, Pinhasi R, Reich D. The Genomic History of Southeastern Europe. Nature 2018 Feb 21. doi: 10.1038/nature25778.
Rusu I, Modi A, Vai S, Pilli E, Mircea C, Radu C, Urduzia, Pinter ZC, Bodolică V, Dobrinescu C, Hervella M, Popescu O, Lari M, Caramelli D, Kelemen B. Maternal DNA lineages at the gate of Europe in the 10th century AD. PLoS ONE 2018 13(3): e0193578. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0193578.
Pilli E, Vai S, Caruso MG, D’Errico G, Berti A., Caramelli D. Neither femur nor tooth: petrous bone for identifying archaeological bone samples via forensic approach.Forensic Science International 2018, 283, pp. 144-149
Tassi F*, Vai S*, Ghirotto S, Lari M, Modi A, Pilli E, Brunelli A, Susca RR, Budnik A, Labuda D, Alberti F, Lalueza-Fox C, Reich D, Caramelli D, Barbujani G. Genome diversity in the Neolithic Globular Amphorae culture and the spread of Indo-European languages. Proceedings of the Royal Society B 2017, 284:20171540. http://dx.doi.org/10.1098/rspb.2017.1540 *these authors contributed equally to this work.
Di Vincenzo F, Lari M, Borsato A, Ghirotto S, Micheli M, Balsamo C, Collina C, De Bellis G, Frisia S, Giacobini G, Gigli E, Hellstrom JC, Lannino A, Modi A, Pietrelli A, Pilli E, Profico A, Ramirez O, Rizzi E, Vai S, Venturo D, Piperno M, Lalueza-Fox C, Barbujani G, Caramelli D, Manzi G. L’uomo di Altamura, vent’anni dopo: nuove ricerche sullo scheletro della grotta di Lamalunga (Altamura, Bari). Studi di Preistoria e Protostoria - 4 – Preistoria e Protostoria della Puglia. A cura di F. Radina. Firenze, 2017. ISBN 978-88-6045-060-9. pp. 181-190.
Modi A, Tassi F, Susca RR, Vai S, Rizzi E, De Bellis G, Lugliè C, Gonzales Fortes G, Lari M, Barbujani G, Caramelli D, Ghirotto S. Complete mitochondrial sequences from Mesolithic Sardinia. Scientific Reports 2017 Oct 5;7:42869. doi:10.1038/srep42869. Epub 2017 Mar 3.
Vai S*, Lari M, Caramelli D. Ancient DNA studies. Alpine and Mediterranean Quaternary, 29 (2), 113-121, 2016. ISSN (print): 2279-7323, ISSN (online): 2279-7335. *corresponding author.
Vai S*, Lari M, Caramelli D. DNA Sequencing in Cultural Heritage. Topics in Current Chemistry Collections February 2016, 374:8. First online: 12 January 2016. DOI 10.1007/s41061-015-0009-8. * corresponding author.
Modi A, Gigli E, Vai S, Scorrano G, Lelli R, Rolfo M, Martinez-Labarga C, Rickards O, Caramelli D, Lari M. Complete mitochondrial genomes of three Early Neolithics from central Italy. Biological and cultural heritage of the central-southern Italian population through 30 thousand years. EPIC (Eredità della Popolazione dell’Italia Centro-meridionale). Proceedings of the PRIN 2010-2011, Universitalia 2016, pp.199-208.
Vai S, Vilaça ST, Romandini M, Benazzo A, Visentini P, Modolo M, Bertolini M, MacQueen P, Austin J, Cooper A, Caramelli D, Lari M, Bertorelle G. The Biarzo case in northern Italy: is the temporal dynamic of swine mitochondrial DNA lineages in Europe related to domestication? Scientific Reports 2015 Nov 9;5:16514. doi: 10.1038/srep16514.
Lari M, Di Vincenzo F, Borsato A, Ghirotto S, Micheli M, Balsamo C, Collina C, De Bellis G, Frisia S, Giacobini G, Gigli E, Hellstrom JC, Lannino A, Modi A, Pietrelli A, Pilli E, Profico A, Ramirez O, Rizzi E, Vai S, Venturo D, Piperno M, Lalueza-Fox C, Barbujani G, Caramelli D, Manzi G. The Neanderthal in the karst: First dating, morphometric, and paleogenetic data on the fossil skeleton from Altamura (Italy). Journal of Human Evolution 2015 May;82:88-94. doi: 10.1016/j.jhevol.2015.02.007. Epub 2015 Mar 21.
Vai S, Ghirotto S, Pilli E, Tassi F, Lari M, Rizzi E, Matas-Lalueza L, Ramirez O, Lalueza-Fox C, Achilli A, Olivieri A, Torroni A, Lancioni H, Giostra C, Bedini E, Pejrani Baricco L, Matullo G, Di Gaetano C, Piazza A, Veeramah K, Geary P, Caramelli D, Barbujani G. Genealogical relationships between early medieval and modern inhabitants of Piedmont. PLoS ONE 2015 Jan 30;10(1):e0116801. doi: 10.1371/journal.pone.0116801.
Pilli E, Casamassima R, Vai S, Virgili A, Barni F, D’Errico G, Berti A, Lago G, Caramelli D. Pet fur or fake fur? A forensic approach. Investigative Genetics 2014, Jun 2; 5:7.
Ghirotto S, Tassi F, Fumagalli E, Colonna V, Sandionigi A, Lari M, Vai S, Petiti E, Corti G, Rizzi E, De Bellis G, Caramelli D, Barbujani G. Origins and evolution of the Etruscans' mtDNA. PLoSONE 2013;8(2):e55519. doi: 10.1371/journal.pone.0055519. Epub 2013 Feb 6.
Vai S, Lari M, Ghirotto S, Rizzi E, Achilli A, Olivieri A, Bedini E, Lippi B, Rabino Massa E, Piazza A, Torroni A, Barbujani G, Caramelli D. Diachronic and Syncronic Genetic Analysis of Ancient Piedmont Population. Journal of Biological Research 2012 n.1 – Vol. LXXXV.
Bedini E, Caramelli D, Giostra C, Lippi B, Mallegni F, Pejrani Baricco L, Petiti E, Vai S. Per una conoscenza dei Longobardi in Italia: primi risultati delle analisi genetiche su individui provenienti da necropoli del Piemonte. VI Congresso Nazionale di Archeologia Medievale (L’Aquila, 12-15 Settembre 2012), a cura di F. Redi e A. Forgione, Firenze 2012, pp.448-451.
LariM, RizziE, MilaniL, CortiG, BalsamoC, VaiS, CatalanoG, PilliE, LongoL, CondemiS, GiuntiP, HanniC, De BellisG, OrlandoL, BarbujaniG, CaramelliD. ‘The microcephalin ancestral allele in a Neanderthal individual’. PLoS ONE 2010 May 14;5(5):e10648.
Caramelli D, Lari M, Rizzi E, Balsamo C, Gigli E, Corti G, Milani L, Vai S, Pilli E, di Vincenzo F, Piperno M, Manzi G, De Bellis G, Lalueza-Fox C, Barbujani G. Analisi paleogenetica del Neanderthal di Altamura. dire in Puglia – Ministero per i Beni e le Attività Culturali, Direzione Regionale per i Beni Culturali e Paesaggistici della Puglia. 2/2010 a cura di Ruggero Martines. BetaGamma editrice, Viterbo, 2010, pag. 45-54.
Caramelli D, Milani L, Vai S, Modi A, Pecchioli E, Girardi M, Pilli E, Lari M, Lippi B, Ronchitelli A, Mallegni F, Casoli A, Bertorelle G, Barbujani G. A 28,000 years old Cro-Magnon mtDNA sequence differs from all potentially contaminating modern sequences. PLoS ONE 2008 Jul 16;3(7):e2700.
Legenda
Education and research:
2004 - Bachelor’s Degree with full marks and honors in Sciences for Nature and the Environment (Faculty of SS.MM.FF.NN) at the University of Camerino.
2007 - Master’s Degree with full marks and honors in Prehistoric Sciences (Faculty of SS.MM .FF.NN) at the University of Ferrara.
2011 - PhD in Anthropological Sciences (XXIII cycle) at the University of Florence with a thesis entitled "Diachronic and synchronic genetic analysis of ancient populations Piedmontese.
2012-2017 - Post-Doc research at the Department of Biology, University of Florence
2018-today – assistant professor at the Department of Biology, University of Florence, SSD BIO/08 – Anthropology
Research interests:
- molecular anthropology
- degraded DNA analysis from ancient samples through PCR and Next Generation Sequencing – NGS
- human evolution, genetic variability in H. neandertalensis and H. sapiens
- H. sapiens population dynamics from Paleolithic up to recent times
- animals and plants domestication processes
- application and development of DNA characterization techniques extracted from ancient samples of different origins (human, animal, vegetable) and nature (bones, teeth, hair, hair, mummified soft tissues, seeds, vegetable fibers, coprolites)
- archaeological excavation in prehistoric contexts
Pubblications:
