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AVVISO: Le lezioni del corso "INTERAZIONE PIANTA-PGPB PER UN'AGRICOLTURA SOSTENIBILE: ASPETTI MOLECOLARI E APPLICATIVI " per l'AA 24/25 si terranno nel secondo semestre.https://e-l.unifi.it/enrol/index.php?id=42974
Sono una ricercatrice interessata alla genetica microbica e vegetale e alle interazioni che si stabiliscono tra piante e microrganismi. Ho conseguito un dottorato in Biologia presso l'Università di Firenze, con un focus sulla colonizzazione delle leguminose da parte dei rizobi, dei batteri simbionti. Nel corso della mia carriera ho lavoratoe collaborato con diversi istituti di ricerca, contribuendo a progetti che spaziano dall'analisi della resistenza agli antibiotici nei reflui agricoli fino allo studio del microbiota associato a organismi superiori. Attualmente, sono Ricercatrice RTDa presso il Dipartimento DAGRI dell’Università di Firenze, dove continuo a sviluppare ricerche su genetica vegetale e batterica applicata all'agricoltura.
Ho ricevuto diversi riconoscimenti per il mio lavoro, tra cui il premio dell'Associazione Genetica Italiana (AGI) per la miglior tesi di dottorato in genetica nel 2017 e una menzione d'onore dalla Firenze University Press per una ricerca di particolare valore scientifico. Inoltre, nel 2018 sono stata premiata dalla Federation of European Microbiological Societies (FEMS) con una Research Travel Grant, che mi ha permesso di svolgere un periodo di ricerca presso il CNRS di Marsiglia, approfondendo lo studio della genetica microbica e delle interazioni tra rizobi e leguminose.
Esperienze Lavorative
Settembre 2022 - presente: Ricercatore Junior (RTDa) presso l'Università di Firenze, Dipartimento di Scienze e Tecnologie Agrarie, Alimentari, Ambientali e Forestali (DAGRI) - Sezione di Genetica
Luglio 2021 - Giugno 2022: Assegnista di ricerca presso l'Università di Bologna, Dipartimento di Scienze e Tecnologie Agro-Alimentari, Laboratorio di Arboricoltura e Frutticoltura e Laboratorio di Microbiologia. Assegno di ricerca: "Plant growth promoting bacteria: physiological and molecular mechanisms underlying the effects on plant phenotype"
Luglio 2019 - Giugno 2021: Assegnista di ricerca presso l'Università di Bologna, Dipartimento di Scienze e Tecnologie Agro-Alimentari, Laboratorio di Microbiologia. Assegno di ricerca: "Studio della presenza di 'antibiotico-resistenze' in reflui suini dopo trattamenti chimico-fisici e biologici"
Gennaio 2019 - Giugno 2019: Assegnista di ricerca presso l'Università di Firenze, Dipartimento di Biologia, Laboratorio di Microbiologia. Assegno di ricerca: "Studio di comunità microbiche coinvolte nel biodeterioramento di superfici lapidee"
Gennaio 2018 - Dicembre 2018: Assegnista di ricerca presso l'Università di Firenze, Dipartimento di Biologia, Laboratorio di Genetica Microbica. Borsa di studio Buzzati-Traverso 2018: "Transplanting very large DNA replicons in bacteria: evaluation of genomic and phenotypic robustness, metabolic modelling and genome content-dependent genes essentiality in hybrid strains"
Gennaio 2018 - Marzo 2018: Post-doc visiting a Marsiglia nel Laboratorio del Dott. Biondi, LCB (Laboratorie de Chimie Bactérienne, Building B'), CNRS - Universitè Aix-Marseille. Borsa di ricerca FEMS: "TIMInG (Transplantation in Multipartite Genome) Transplanting very large replicons in bacteria: experimental evaluation of genomic and phenotypic robustness of bacterial strains with hybrid cis-genic multipartite genome"
Gennaio 2017 - Dicembre 2017: Borsa di ricerca presso l'Università di Firenze, Dipartimento di Biologia, Laboratorio di Genetica Microbica. Borsa di Ricerca: "Analisi molecolare del microbiota nel tumore del colon retto"
Novembre 2013 - Aprile 2017: Dottoranda in Biologia presso il Dipartimento di Biologia, Università di Firenze, Laboratorio di Genetica Microbica, sotto la supervisione del Prof. Alessio Mengoni
Settembre 2015: Dottoranda visiting presso il Dipartimento di Biotecnologie, Intercollegiate Faculty of Biotechnology UG&MUG, Danzica, Polonia, sotto la supervisione della Prof.ssa Ewa Łojkowska
Marzo 2013 - Giugno 2013: Tirocinio curriculare presso il Dipartimento di Malattie Infettive del Leiden University Medical Center (LUMC), Università di Leiden, Paesi Bassi
Aprile 2011 - Luglio 2011: Tirocinio extracurriculare (finanziato dalla Regione Toscana) presso il laboratorio di controllo qualità biologico della società farmaceutica Eli Lilly S.p.A., via Antonio Gramsci, 733, 50019 Sesto Fiorentino (Firenze)
Istruzione e Formazione
Dottorato in Biologia, curriculum Genetica e Microbiologia (Novembre 2013 - Aprile 2017) presso il Laboratorio di Genetica Microbica, Università di Firenze. Tesi di dottorato: "Plant colonization: exploring the genetic basis of rhizobial symbiotic performance and bacterial invasion."
Laurea Magistrale (Ottobre 2011 - Ottobre 2013) in Biologia: Laureata con 110/110 e lode presso l'Università di Firenze con una tesi biocomputazionale e sperimentale basata sul tirocinio curriculare svolto presso il Dipartimento di Malattie Infettive del LUMC, Università di Leiden, Paesi Bassi.
Laurea Triennale (Ottobre 2007 - Aprile 2011) in Biologia, presso l'Università di Firenze.
Premi e Finanziamenti
FEMS Meeting Grant per Microbial Diversity 2021, 14-15 dicembre 2021
Congress Grant Award FEMS 2019, Glasgow (Scozia, UK), 7-11 luglio 2019
Borsa di studio Fondazione Adriano Buzzati Traverso per il 2018
FEMS Research Travel Grant per il progetto "TIMInG (Transplantation in Multipartite Genome)" per tre mesi (gennaio - aprile 2018) a Marsiglia nel Laboratorio del Dott. Biondi, LCB (Laboratorie de Chimie Bactérienne, Building B'), CNRS - Universitè Aix-Marseille
Borsa AGI (Associazione Genetica Italiana) 2017 sponsorizzata da Zanichelli Editore S.p.A. per la migliore tesi di dottorato in genetica
FUP (Firenze University Press), Premio Tesi di Dottorato 2017, menzione d'onore per ricerca di particolare valore scientifico
Attività Editoriale
Special Issue Editor per "Evolution and Genetic of Plant-Microbes Interaction" in Plants/MDPI
Special Issue Editor per "Plant-Microorganisms Symbiosis: Genetic and Molecular Basis of Host Plant’s Choice" in Plants/MDPI
Guest Editor per "Optimizing Probiotic Applications in Agriculture" in Frontiers in Microbiology
Review Editor per Systems Biology in Frontiers
Review Editor per Evolutionary and Genomic Microbiology in Frontiers in Microbiology/Genetics
Affiliazioni a Società Scientifiche
SIGA (Società Italiana di Genetica Agraria)
SIMTREA (Società Italiana di Microbiologia Agraria, Alimentare e Ambientale)
Organizzazione di Conferenze
Membro del Comitato Organizzatore della Conferenza Nazionale AISSA#UNDER40 2024, 26-27 giugno 2024, Firenze.
Parte del Comitato Scientifico della Conferenza Nazionale AISSA#UNDER40 2025, 5-7 giugno 2025, Portici (NA).
Titoli Accademici
Abilitazione Scientifica Nazionale a Professore Associato per il settore 07/I1 - Microbiologia Agraria (validità 31/01/2022 - 31/01/2031)
Abilitazione Scientifica Nazionale a Professore Associato per il settore 07/E1 - Chimica Agraria, Genetica Agraria e Pedologia (validità 21/11/2023 - 21/11/2034)
Sono su:
ResearcGate https://www.researchgate.net/profile/Alice_Checcucci
Scopus https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=56436203000
Loop https://loop.frontiersin.org/people/339967/overview
Orchidhttps://orcid.org/0000-0002-0019-0997
LinkedIn https://www.linkedin.com/in/alice-checcucci-23632184?originalSubdomain=it
Determinanti genetici coinvolti nelle interazioni pianta-microrganismi per il miglioramento della produzione agricola
Valutazione dell'attività metabolica nei protoplasti e nelle cellule vegetali
Geni delle piante coinvolti nella risposta allo stress
Legenda
I'm a researcher with expertise in microbial genetics and plant-microorganism interactions, with experience in microbiology, biotechnology, and sustainable agriculture. I obtained a PhD in Biology from the University of Florence, focusing on plant colonization by symbiotic bacteria. Throughout my career, I have worked and collaborated with various national and international research institutes, contributing to projects ranging from the analysis of antibiotic resistance in agricultural wastewater to the study of microbiota associated with superior organisms. Currently, I am a Junior Researcher at the DAGRI Department of the University of Florence, where I continue to conduct research on genetics and applied microbiology in agriculture.
I have received several awards for my work, including the Italian Genetics Association (AGI) prize for the best PhD thesis in genetics in 2017 and an honorable mention from Firenze University Press for research of particular scientific value. Additionally, in 2018, I was awarded a Research Travel Grant from the Federation of European Microbiological Societies (FEMS), which allowed me to conduct research at CNRS in Marseille, deepening my studies in microbial genetics and plant-microorganism interactions.
Work Experience
- September 2022-present Junior Researcher (RTDa) at the University of Florence, Department of Agriculture, Food, Environment and Forestry (DAGRI) - Genetics Section
- July 2021- June 2022, Postdoctoral Researcher at the University of Bologna, Department of Agricultural and Food Science, Laboratory of Arboriculture and Fruticulture and Laboratory of Microbiology. Assegno di ricerca: “Plant growth promoting bacteria: physiological and molecular mechanisms underlying the effects on plant phenotype”
- July 2019 – June 2021, Postdoctoral Researcher at the University of Bologna, Department of Agricultural and Food Science, Laboratory of Microbiology. Assegno di ricerca: “Studio della presenza di 'antibiotico-resistenze' in reflui suini dopo trattamenti chimico-fisici e biologici"
- January 2019 - June 2019, Postdoctoral Researcher at the University of Florence, Department of Biology, Laboratory of Microbiology. Assegno di ricerca: "Studio di comunità microbiche coinvolte nel biodeterioramento di superfici lapidee"
- January 2018 - December 2018, Postdoctoral Researcher at the University of Florence, Department of Biology, Laboratory of Microbial Genetics. Buzzati-Traverso Fellowship 2018: “Transplanting very large DNA replicons in bacteria: evaluation of genomic and phenotypic robustness, metabolic modelling and genome content-dependent genes essentiality in hybrid strains”
- January 2018 - March 2018, Visiting Post-Doc in Marseille in Dott. Biondi’s Lab, LCB (Laboratorie de Chimie Bactérienne, Building B'), CNRS - Universitè Aix-Marseille.FEMS Research Fellowhship: “TIMInG (Transplantation in Multipartite Genome)Transplanting very large replicons in bacteria: experimental evaluation of genomic and phenotypic robustness of bacterial strains with hybrid cis-genic multipartite genome”
- January 2017- December 2017, Research Fellowship at University of Florence, Department of Biology, Laboratory of Microbial Genetics. Borsa di Ricerca: “Analisi molecolare del microbiota nel tumore del colon retto”
- November 2013- April 2017, PhD student in Biology in the Department of Biology, University of Florence, Laboratory of Microbial Genetics, under the supervision of Prof. Alessio Mengoni
- September 2015, Visiting PhD student at Department of Biotechnology, Intercollegiate Faculty of Biotechnology UG&MUG, Gdansk, Poland, under the supervision of Prof. Ewa Łojkowska
- March 2013- June 2013, curricular internship in the Dept. of Infectious Disease in Leiden University Medical Center (LUMC), Leiden University, Leiden, The Netherlands
- April 2011- July 2011, extracurricular internship (supported by Regione Toscana) in the biological laboratory quality control of the pharmaceutical company Eli Lilly S.p.A.,via Antonio Gramsci, 733, 50019 Sesto Fiorentino (Firenze)
Education and Training
- PhD in Biology, curriculum Genetics and Microbiology (November 2013 - April 2017) in the Laboratory of Microbial Genetics, University of Florence. PhD thesis: “Plant colonization: exploring the genetic basis of rhizobial symbiotic performance and bacterial invasion.”
- Master’s degree (October 2011-October 2013): I graduated with the score 110/110 cum laude at University of Florence with a biocomputational and experimental thesis. The thesis was based on the curricular internship performed in the Dept. of Infectious Disease at LUMC, Leiden University, Leiden (The Netherlands).
- Bachelor’s degree (October 2007-April 2011) at University of Florence.
Prizes and Grants
- FEMS Meeting Grant for Microbial Diversity 2021, 14-15 December 2021
- Congress Grant Award FEMS 2019, Glasgow (Scotland, UK),7-11, July 2019
- Fondazione Adriano Buzzati Traverso Fellowship for 2018
- FEMS Research Travel Grant for the project entitled "TIMInG (Transplantation in Multipartite Genome)" for three months (from January to April 2018) in Marseille in Dott. Biondi’s Lab, LCB (Laboratorie de Chimie Bactérienne, Building B'), CNRS - Universitè Aix-Marseille
- AGI (Italian Genetics Association) Grant 2017 sponsored by Zanichelli Editore S.p.A. for the best genetics PhD thesis
-FUP (Firenze University Press), Award PhD thesis 2017, honor mention for research with particular scientific value
-FEMS Meeting Grant for BAGECO 14 (Bacterial Genetics and Ecology), Aberdeen (Scotland), 4-8, June 2017
-FEMS Meeting Grant for 12th European Nitrogen Fixation Conference, Budapest (Hungary), 25-28, August 2016
-SIMGBM contribute for the participation to FISV XIV Congress, Rome, September 20-23, 2016
Editorial Activity
- Special Issue Editor of the Research Topic “Evolution and Genetic of plant-microbes interaction” in Plants/MDPI https://www.mdpi.com/journal/plants/special_issues/5148TJFR9Y
- Special Issue Editor of the Research Topic “Plant–Microorganisms Symbiosis: Genetic and Molecular Basis of Host Plant’s Choice” in Plants/MDPI https://www.mdpi.com/journal/plants/special_issues/IU86GPOES2
-Guest Editor of the Research Topic “Optimizing Probiotic Applications in Agriculture: Exploring the Role of Growth and Health Promoter's Microorganisms in Plants and Livestock Animals” in Frontiers in Microbiology, https://www.frontiersin.org/research-topics/18730/optimizing-probiotic-applications-in-agriculture-exploring-the-role-of-growth-and-health-promoters-m
- Review Editor for the Editorial Board of Systems Biology, a section of “Frontiers in Applied Mathematics and Statistics/ Genetics/ Neuroscience/ Physiology”
- Review Editor for the Editorial Board of Evolutionary and Genomic Microbiology, a section of “Frontiers in Microbiology/ Genetics”
Affiliations to Scientific Societies
SIMTREA (Società Italiana di Microbiologia Agraria e Alimentare e Ambientale)
Organization of conferences
Member of the Organizing Committee of the AISSA#UNDER40 National Scientific Conference 2024, 26-27 June 2024, Florence.
Part of the Scientific Committee of the AISSA#UNDER40 National Scientific Conference 2025, 5-7 June 2025, Portici (NA).
Academic Titles
-Achievement of the National Scientific qualification as Associate Professor in the Italian higher education system, in the call 2021/2023 (Ministerial Decree n. 553/2021 and 589/2021) for the disciplinary field of 07/I1 - Agricultural microbiology. (Academic Recruitment Field 07/I - Agricultural microbiology, according to the national classification).
The validity of the qualification is nine years, starting from the 31/01/2022 and will expire on the 31/01/20311.
-Achievement of the National Scientific qualification as Associate Professor in the Italian higher education system, in the call 2021/2023 (Ministerial Decree n. 553/2021 and 589/2021) for the disciplinary field of 07/E1 - Agricultural chemistry, agricultural genetics and pedology. (Academic Recruitment Field 07/E - Agricultural chemistry, agricultural genetics and pedology, according to the national classification).
The validity of the qualification is eleven years1, starting from the 21/11/2023 and will expire on the 21/11/2034.
I'm on:
