Tutti i giorni ore 12-13

Dr. Giorgio F. Signorini

Laureato Tecnico Pagina personale    (>> link esterno)

ATTIVITÀ

1. Didattica e di ricerca: metodi avanzati di simulazione di sistemi molecolari, in particolare metodi di insieme generalizzato per l'esplorazione di proprietà strutturali di sistemi di interesse biologico
2. gestione di risorse di calcolo; scrittura e manutenzione di programmi per il calcolo scientifico.

Curriculum Vitae

ISTRUZIONE

Superiore:

Liceo Classico ``Dante'', Firenze (1973-1978)
voto di maturità: 60/60

Università:

Laurea in Chimica, Università di Firenze (1979-1985)
Voto finale: 110/110 e lode
Media esami: 29.7/30.
Tesi in Spettroscopia Molecolare: ``Dinamica reticolare e processi anarmonici in cristalli molecolari: Antracene and Azoto'' (Relatore: Prof. V. Schettino)

Ph. D.:

Dottorato di Ricerca in Scienze Chimiche, curriculum Chimica Fisica dello Stato Solido (1986-1989)
Tesi: ``Proprietà dinamiche e processi di rilassamento in sistemi molecolari condensati''

OCCUPAZIONE

• Post-Doctoral Fellow alla University of Pennsylvania, Philadelphia, USA; Prof. Michael L. Klein (1989-1990)
• Contratto di Studio IBM-Università di Firenze: ``Sperimentazione del collegamento di sistemi di tipo diverso in token-ring e migrabilità di applicazioni in ambiente UNIX'' (1990-1991)
• Tecnico di Elevata Professionalità (cat EP) presso il Dipartimento di Chimica dell'Università di Firenze (1991-present)

CAMPI DI RICERCA

potenziali intermolecolari:

modelli di potenziali intermolecolari e loro uso in metodi di calcolo come la Dinamica Molecolare (MD) e la Dinamica Reticolare (Lattice Dynamics, LD); campi di forza trasferibili; contributo delle diverse parti del potenziale all'anarmonicità; simulazione della transizione cristallo-liquido

stati vibrazionali di cristalli molecolari:

LD armonica e anarmonica di cristalli molecolari; LD anarmonica di cristalli ionico-molecolari: trattazione e metodo di calcolo; processi di rilazzamento di fononi interni e esterni, larghezza di righe vibrazionali; calcolo approssimato di contributi di alto ordine alla larghezza di riga; effetto di temperatura e pressione sulla larghezza di riga; contributo del disordine orientazionale alla larghezza di riga: trattazione comparata MD/LD;

proprietà spettroscopiche di cristalli con impurezze:

rilassamento vibrazionale di una molecola ``ospite'' in un cristallo molecolare; dipendenza dalla pressione delle frequenze di bande vibroniche di molecole in matrice di gas rari;

dinamica di liquidi molecolari:

struttura del liquido e suo rilassamento intorno al punto di transizione liquido-vetro, confronto tra risultati di simulazioni MD e previsioni della teoria mode-coupling; rilassamento di gradi di libertà rotazionali

struttura di proteine:

studio dello stato di protonazione favorito dell’istidina mediante calcoli di meccanica molecolare e analisi statistica delle energie delle strutture sperimentali pubblicate

dinamica molecolare di proteine:

studio della conformazione di piccole proteine in acqua mediante dinamica molecolare classica usando potenziali all-atom; tecniche di insieme generalizzato (REM, SGE) e di nonequilibrio (Crooks-Jarzynski) per il campionamento efficace di superfici di potenziale complesse: approfondimenti teorici e applicazioni a sistemi modello. Studio della struttura a β-hairpin di derivati del dominio B1 della proteina G.

ALTRI INTERESSI PROFESSIONALI

archeometria:

metodi spettroscopici non distruttivi per l'analisi di pigmenti di interesse archeologico

calcolatori e reti:

gestione di elaboratori centrali (IBM-VM/CMS) e stazioni di lavoro UNIX; progettazione e gestione di reti TCP/IP; gestione server DNS, HTTP, etc.; gestione del servizio di posta elettronica

ATTIVITÀ DIDATTICA

• Lezioni nell'ambito del corso di Laboratorio di Programmazione e Calcolo (Corso di Laurea in Chimica, Università di Firenze), in qualità di esperto. Argomento: ``Scrittura ed esecuzione di programmi FORTRAN''. 22 ore.
  Anno Accademico 1990/91
• Seminari nell'ambito del corso di Chimica Teorica (Corso di Laurea in Chimica, Università di Firenze), in qualità di esperto. Argomento: ``Introduzione al sistema operativo VM''. 2 seminari.
  Anno Accademico 1990/91
• Esercitazioni nell'ambito del corso di Chimica Fisica dello Stato Solido (Corso di Laurea in Chimica, Università di Firenze). 3 ore. Argomento: ``Calcoli di Dinamica Reticolare su Cristalli Ionici''.
  Anno Accademico 1994/95
• Lezione per il Corso di Formazione/Aggiornamento per Insegnanti della Scuola Secondaria Superiore, organizzato dalla Facoltà di SMFN dell'Università di Firenze in collaborazione con il Provveditorato agli Studi. 3 ore con esercitazioni. Argomento: ``Le risorse didattiche per la chimica in Internet''.
  Firenze, maggio 1999.
• Lezioni ed esercitazioni nell'ambito del corso di Chimica Teorica (Corso di Laurea in Chimica, Università di Firenze) Argomento: ``Simulazioni di Dinamica Molecolare''. 4 ore.
  Anno Accademico 2000/2001.
• Lezioni ed esercitazioni nell'ambito del corso di Chimica Teorica (Corso di Laurea in Chimica, Università di Firenze) Argomento: ``Simulazioni di Dinamica Molecolare''. 2 ore.
  Anno Accademico 2001/2002.
• Corso ``Abilità Informatiche'' (Corso di Laurea in Chimica e Corso di Laurea in Chimica Applicata, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a UNIX e al software libero di utilità per chimici''. 48 ore di lezioni/esercitazioni
  Anno Accademico 2001/2002
• Corso ``Conoscenze Informatiche'' (Corso di Laurea in Tecnologia per la Conservazione e il Restauro dei Beni Culturali, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a Internet''. 25 ore di lezioni e esercitazioni
  Anno Accademico 2001/2002
• Corso ``Conoscenze Informatiche'' (Corso di Laurea in Tecnologia per la Conservazione e il Restauro dei Beni Culturali, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a Internet''. 23 ore di lezioni e esercitazioni
  Anno Accademico 2002/2003
• Corso ``Abilità Informatiche'' (Corso di Laurea in Chimica e Corso di Laurea in Chimica Applicata, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a UNIX''. 20 ore di lezioni/esercitazioni
  Anno Accademico 2002/2003
• Corso ``Conoscenze Informatiche'' (Corso di Laurea in Tecnologia per la Conservazione e il Restauro dei Beni Culturali, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a Internet''. Lezioni e esercitazioni
  Anno Accademico 2003/2004
• Corso ``Abilità Informatiche'' (Corso di Laurea in Chimica e Corso di Laurea in Chimica Applicata, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a UNIX''. Lezioni/esercitazioni
  Anno Accademico 2003/2004
• Corso ``Conoscenze Informatiche'' (Corso di Laurea in Tecnologia per la Conservazione e il Restauro dei Beni Culturali, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a Internet''. Lezioni e esercitazioni
  Anno Accademico 2004/2005
• Corso ``Abilità Informatiche'' (Corso di Laurea in Chimica e Corso di Laurea in Chimica Applicata, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a UNIX''. Lezioni/esercitazioni
  Anno Accademico 2004/2005
• Corso ``Conoscenze Informatiche'' (Corso di Laurea in Tecnologia per la Conservazione e il Restauro dei Beni Culturali, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a Internet''. Lezioni e esercitazioni
  Anno Accademico 2005/2006
• Corso ``Abilità Informatiche'' (Corso di Laurea in Chimica e Corso di Laurea in Chimica Applicata, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a UNIX''. Lezioni/esercitazioni
  Anno Accademico 2005/2006
• Corso ``Struttura e Dinamica di Biomolecole'' (Corso di Laurea Specialistica in Chimica delle Molecole di Interesse Biologico, Università di Firenze)
  Simulazione di un semplice polipeptide nel vuoto con dinamica guidata
  Progetto di laboratorio
  Anno Accademico 2005/2006
• Corso ``Abilità Informatiche'' (Corso di Laurea in Chimica e Corso di Laurea in Chimica Applicata, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a UNIX e Internet ''. Lezioni/esercitazioni
  Anno Accademico 2006/2007
• Corso ``Conoscenze Informatiche'' (Corso di Laurea in Tecnologia per la Conservazione e il Restauro dei Beni Culturali, Università di Firenze)
  Modulo: ``Introduzione a Internet''. Lezioni e esercitazioni
  Anno Accademico 2006/2007
• Corso ``Chimica Teorica'' (Corso di Laurea in Chimica, Università di Firenze)
  Scrittura di un programma di calcolo per simulazione Montecarlo dell'acqua allo stato liquido
  Esercitazione
  Anno Accademico 2006/2007
• Corso ``Struttura e Dinamica di Biomolecole'' (Corso di Laurea Specialistica in Chimica delle Molecole di Interesse Biologico, Università di Firenze)
  Simulazione di un semplice polipeptide nel vuoto con dinamica guidata
  Progetto di laboratorio
  Anno Accademico 2006/2007
• Corso ``Chimica Teorica'' (Corso di Laurea in Chimica, Università di Firenze)
  Simulazione Montecarlo e calcolo di g(r)
  Lezioni ed esercitazioni al calcolatore
  Anno Accademico 2007/2008
• Corso ``Struttura e Dinamica di Biomolecole'' (Corso di Laurea Specialistica in Chimica delle Molecole di Interesse Biologico, Università di Firenze)
  Elementi di meccanica statistica e simulazioni di Dinamica Molecolare
  Lezioni ed esercitazioni al calcolatore
  Anno Accademico 2007/2008
• Corso ``Struttura e Dinamica di Biomolecole'' (Corso di Laurea Specialistica in Chimica delle Molecole di Interesse Biologico, Università di Firenze)
  Elementi di meccanica statistica
  Lezioni
  Simulazioni di Dinamica Molecolare e metodi di calcolo avanzati per la valutazione della stabilità conformazionale di proteine
  Esercitazioni al calcolatore
  Anno Accademico 2008/2009
• Corso “Struttura e Dinamica Molecolare di Sistemi Biologici” (Corso di Laurea Magistrale in Scienze Chimiche, Università di Firenze)
  Metodi avanzati di simulazione
  Lezioni
  Simulazioni di Dinamica Molecolare e metodi di calcolo avanzati per la valutazione della stabilità conformazionale di proteine
  Esercitazioni al calcolatore
  Anno Accademico 2009/2010
• Corso “Struttura e Dinamica Molecolare di Sistemi Biologici” (Corso di Laurea Magistrale in Scienze Chimiche, Università di Firenze)
  Simulazioni di Dinamica Molecolare e metodi di calcolo avanzati per la valutazione della stabilità conformazionale di proteine
  Esercitazioni al calcolatore
  Anno Accademico 2010/2011
• Corso “Struttura e Dinamica Molecolare di Sistemi Biologici” (Corso di Laurea Magistrale in Scienze Chimiche, Università di Firenze)
  Simulazioni di Dinamica Molecolare e metodi di calcolo avanzati per la valutazione della stabilità conformazionale di proteine
  Esercitazioni al calcolatore
  Anno Accademico 2011/2012
• Corso “Materiali Ceramici e Vetro” (Corso di Laurea Triennale in Chimica, Università di Firenze)
  Aspetti strutturali dei vetri
  Ciclo di 6 Lezioni
  Anno Accademico 2013/2014
• Corso “Materiali Ceramici e Vetro” (Corso di Laurea Triennale in Chimica, Università di Firenze)
  Aspetti strutturali dei vetri
  Ciclo di 6 Lezioni
  Anno Accademico 2014/2015

TESI DI LAUREA

• Correlatore in Tesi di Laurea in Chimica: ”Studio dei complessi tra Fe-protoporfirina IX e peptidi amiloidi mediante metodi di meccanica e dinamica molecolare”, Univ. Firenze, facoltà Scienze MFN, a.a. 2004-05
• Correlatore in Tesi di Laurea in Chimica: ”Determinazione dell’energia libera di stati metastabili in sistemi chimici mediante simulazioni replica-exchange”, Univ. Firenze, facoltà Scienze MFN, a.a. 2007-08
• Correlatore in Tesi di Laurea in Chimica: ”Studi di conformazioni della Poliprolina attraverso dinamica molecolare atomistica”, Univ. Firenze, facoltà Scienze MFN, a.a. 2009-10

List of Publications

1

Giorgio F. Signorini, Pier Francesco Fracassi, Roberto Righini, and Raffaele Guido Della Valle.
Energy decay mechanisms and anharmonic lattice dynamics: the case of solid nitrogen.
Chem. Phys., 100:315-329, 1985.

2

Gianni Cardini, Giorgio F. Signorini, Pier R. Salvi, and Roberto Righini.
Molecular dynamics and head-tail disorder in the Raman Spectrum of crystalline .
Chem. Phys. Letters, 142:570-574, 1987.

3

Giorgio F. Signorini, J.L. Barrat, and M.L. Klein.
Structural relaxation and dynamical correlations in a molten salt near the liquid-glass transition: a molecular dynamics study.
J. Chem. Phys., 92:1294-1303, 1990.

4

Giorgio F. Signorini, Roberto Righini, and Vincenzo Schettino.
Lattice dynamics of the orthorhombic phase of : Ewald's method in molecular coordinates.
Chem. Phys., 154:245-261, 1991.

5

Piero Procacci, Giorgio F. Signorini, and R.G. Della Valle.
Efficient calculation of high-order self-energy corrections to phonon linewidths: application to -Nitrogen.
Phys.Rev.B,, 47:11124-11133, 1993.

6

Claudia Taiti, Paolo Foggi, Giorgio F. Signorini, and Vincenzo Schettino.
Vibrational relaxation of a impurity mode in crystal.
Chem.Phys.Lett., 212:283-288, 1993.

7

Claudia Taiti, Paolo Foggi, Giorgio F. Signorini, and Vincenzo Schettino.
Linewidth temperature dependence of the mode of ion doped in crystal.
In Emilio Castellucci, Roberto Righini, and Paolo Foggi, editors, Coherent Raman Spectroscopy. World Scientific, 1993.

8

M. Jordan, A. Schuch, Roberto Righini, Giorgio F. Signorini, and Hans J. Jodl.
Phonon relaxation processes in at high pressure and low temperature.
J.Chem.Phys., 101:3436-3443, 1994.

9

Giorgio F. Signorini, Maurizio Becucci, and Emilio Castellucci.
Raman linewidths in ferroelectric .
Chem. Phys., 187:263-273, 1994.

10

M.Semling, M.Jordan, K.Syassen, Hans J. Jodl, and Giorgio F. Signorini.
Luminescence spectra of matrix isolated at high pressure and low temperature.
J. Chem. Phys., 106:1336-1345, 1997.

11

Raffaele Guido Della Valle, Giorgio F. Signorini, and Piero Procacci.
Vibrational density of states and homogeneous linewidth in molecular crystals: many-phonon processes in nitrogen.
Phys. Rev. B, 55:14855-14864, 1997.

12

Giorgio F. Signorini, Claudia Taiti, and Barbara Caldarone.
Anharmonic linewidth calculation in 1,4-dibromobenzene and disordered 1,4-bromochlorobenzene.
Mol. Cryst. Liq. Cryst., 307:189, 1997.

13

Angela Zoppi, Giorgio F. Signorini, Luca Bachechi, and Franco Lucarelli.
Characterization of painting materials from eritrea rock art sites with non-destructive spectroscopic techniques.
Journal of Cultural Heritage, 3:299-308, 2002.

14

Giorgio F. Signorini, Riccardo Chelli, Piero Procacci, and Vincenzo Schettino.
Energetic fitness of histidine protonation states in PDB structures.
Journal of Physical Chemistry B, 108:12252-12257, 2004.

15

P. Procacci, S. Marsili, A. Barducci, Giorgio F. Signorini, and R. Chelli.
Crooks equation for steered molecular dynamics using a Nosé-Hoover thermostat.
J. Chem. Phys., 125:164101, 2006.

16

S. Marsili, Giorgio F. Signorini, R. Chelli, M. Marchi, and P. Procacci.
Orac: A molecular dynamics simulation program to explore free energy surfaces in biomolecular systems at the atomistic level.
J. Comput. Chem., 31:1106-1116, 2010.

17

R. Chelli and Giorgio F. Signorini.
Serial generalized ensemble simulations of biomolecules with self-consistent determination of weights.
Journal of Chemical Theory and Computation, 8(3):830-842, 2012.

18

Carlo Guardiani, Giorgio F. Signorini, Roberto Livi, Anna Maria Papini, and Piero Procacci.
Conformational landscape of n-glycosylated peptides detecting autoantibodies in multiple sclerosis, revealed by hamiltonian replica exchange.
The Journal of Physical Chemistry B, 116(18):5458-5467, 2012.

19 Giorgio F. Signorini, Edoardo Giovannelli, Yannick G. Spill, Michael Nilges, and Riccardo Chelli.

Convective replica-exchange in ergodic regimes.

Journal of Chemical Theory and Computation, 10(3):953–958, 2014. doi: 10.1021/ct401033g. URL http://dx.doi.org/10.1021/ct401033g.

 

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