Il corso di CHIMICA DEI COMPOSTI ETEROCICLICI inizierà lunedì 22 settembre in aula Speroni (Dip. Chimica) alle ore 11:00. Gli studenti interessati a seguire il corso sono invitati ad iscriversi su Moodle.
Per appuntamento:
tel. 055 4573507
email. andrea.trabocchi@unifi.it
Andrea Trabocchi è professore associato di Chimica organica presso il Dipartimento di Chimica dell'Università di Firenze e Presidente del Corso di Laurea Magistrale in Biotecnologie Molecolari. Gli interessi di ricerca sono nell’ambito della sintesi organica di eterocicli bioattivi e della chimica peptidomimetica, con applicazioni nel drug discovery in campo oncologico e delle infezioni virali. Da anni lavora all’identificazione di inibitori di enzimi coinvolti nella malattia di Alzheimer. È coinvolto in progetti di imaging molecolare, è membro del Centro di imaging di Ateneo CIRIB ed è stato vicedirettore del precedente Centro Interdipartimentale per lo Sviluppo Preclinico dell’Imaging Molecolare CISPIM (2017-2023). È membro del Consiglio Direttivo di AIRAlzh dal 2023. Ha conseguito un dottorato in Scienze chimiche nel 2003 presso l'Università di Firenze e ha ricevuto formazione sulla chimica dei peptidi presso l'Imperial College di Londra. Ha pubblicato > 100 articoli scientifici e ha depositato 5 brevetti. Inoltre, è autore di tre libri, Diversity-Oriented Synthesis (Wiley, 2013), Small Molecule Drug Discovery (Elsevier, 2019), Peptidomimetics in Organic and Medicinal Chemistry (Wiley, 2014). Da febbraio 2023 è membro dell'Advisory board di Chemical Society Reviews, RSC (IF 39).
ANDREA TRABOCCHI
Professore Associato di Chimica Organica
Presidente del Corso di Laurea Magistrale in Biotecnologie Molecolari
Indirizzo
Dipartimento di Chimica "Ugo Schiff", Università degli Studi di Firenze
Polo Scientifico e Tecnologico, Via della Lastruccia 13, 50019 Sesto Fiorentino (FI)
+39 055 4573507 (tel)
e-mail andrea.trabocchi@unifi.it
ORCID http://orcid.org/0000-0003-1774-9301
Formazione e abilitazioni
- Diploma di Specializzazione in Biochimica Clinica, area non medica (50/50), Università degli Studi di Roma “Tor Vergata”, 2016
- Dottorato di Ricerca in Scienze Chimiche, Università degli Studi di Firenze, 2003 (XV Ciclo)
- Abilitazione alla Professione di Chimico, 1999
- Laurea in Chimica (110/110), Università degli Studi di Firenze, 1998
- Abilitazione scientifica nazionale alle funzioni di professore universitario di Prima
Fascia, anno 2016, 4° quadrimestre, settore 03/C1-Chimica Organica, 6 aprile 2018 – 6 aprile 2029
- Abilitazione scientifica nazionale alle funzioni di professore universitario di Seconda
Fascia, anno 2012, settore 03/C1-Chimica Organica, 11 dicembre 2013 - 11 dicembre 2019
Attività di Ricerca
Interessi di ricerca nel campo della sintesi organica: sviluppo di nuove molecole eterocicliche come amminoacidi e peptidomimetici; sviluppo di molecole eterocicliche basate sul concetto della Diversity Oriented Synthesis; sviluppo di nuove metodologie di sintesi di eterocicli organo- e metallocatalizzate, in collaborazione con il prof. Dixon, Oxford University.
Applicazioni nell’ambito della chimica farmaceutica: progettazione e sintesi di ligandi di integrine e di inibitori di proteasi e metalloproteasi.
Ricerca nel campo della chemical genetics: generazione di librerie di molecole piccole e screening fenotipici su cellula o zebrafish, in collaborazione con KIT-ComPlat, Karlsruhe, Germania.
Attività di ricerca nell’ambito dell’imaging molecolare: sviluppo di nuovi traccianti molecolari per imaging molecolare.
- Professore Associato, ssd CHIM/06, sc 03/C1 (Chimica organica), presso il Dipartimento di Chimica “U. Schiff”, Università di Firenze, 2017-oggi
- Ricercatore a tempo determinato, tipologia (b), (art. 24, c.3-b, L. 240/10), ssd CHIM/06, sc 03/C1 (Chimica organica), presso il Dipartimento di Chimica “U. Schiff”, Università di Firenze, 2014-2017
- Ricercatore a tempo determinato, tipologia (a), (art. 24, c.3-a, L. 240/10), ssd CHIM/06, sc 03/C1 (Chimica organica), presso il Dipartimento di Chimica “U. Schiff”, Università di Firenze, 2013-2014
- Ricercatore a tempo determinato (art. 1, comma 14, L. 230/05), ssd CHIM/06 (Chimica organica), presso il Dipartimento di Chimica “U.Schiff”, Università di Firenze, 2007-2013
Responsabile di assegni e borse di ricerca (dal 2017)
Assegni di ricerca
- Lorenzo Calugi, Sviluppo di peptidomimetici inibitori dell'interazione ACE2- proteina Spike S per il trattamento di infezioni da Coronavirus, 2021
- Lorenzo Calugi, Progettazione e sintesi di inibitori di secretasi coinvolte nella malattia di Alzheimer, 2 anni, 2019 e 2020
- Elena Lenci, Progettazione e sintesi di inibitori peptidomimetici di Metalloproteasi di Matrice per la diagnosi e terapia antiangiogenica dei tumori, 4 anni, 2018-2022
- Elena Lenci, Progettazione e sintesi di inibitori peptidomimetici di Beta-Secretasi I per la diagnosi e il trattamento delle placche amiloidi nel morbo di Alzheimer, 1 anno, 2017-2018
Borse di ricerca
- Lorenzo Baldini, Sintesi di nuovi amminoacidi ciclici per lo sviluppo di peptidomimetici antivirali, 2024
- Aldo Chirico, Progettazione e sintesi di peptidomimetici ad azione antivirale diretta verso SARS-CoV-2, 2023-2024
- Filomena Tedesco, Sintesi di peptidomimetici e di bioconiugati PROTAC per la degradazione di proteine virali, 2022
- Filomena Tedesco, Sintesi di amminoacidi eterociclici per lo sviluppo di inibitori peptidomimetici dell'interazione ACE2 e proteina Spike di SARS-CoV-2, 2021-2022
- Riccardo Innocenti, Sviluppo di peptidomimetici per il trattamento e monitoraggio con imaging SPECT dell’angiogenesi di tumori, 2016-2019
Collaborazioni scientifiche
- Prof Stefan Bräse, KIT-Compound Platform (ComPlat), Karlsruhe, Germania, per lo screening fenotipico di librerie DOS sintetizzate nei nostri laboratori, dal 2016
- Prof. Stefano Rusconi, Università degli Studi di Milano e Ospedale Luigi Sacco, per lo studio di citotossicità di inibitori peptidomimetici di HIV proteasi in isolati primari HIV+ dal 2012 e di inibitori della replicazione virale di SARS-CoV-2 dal 2022
- Prof Dr Andreas Brunschweiger, Wurzburg University, Germania, per lo sviluppo e screening di DNA-encoded chemical libraries, dal 2021
- Dr. Claudia Lalli, Rennes Institute of Chemical Sciences e CNRS, Francia, nell’ambito di sintesi eterociclica applicata a drug discovery, dal 2021
- Prof Mads H. Clausen, Technical University of Denmark (DTU), nell’ambito di small molecule e fragment-based drug discovery, dal 2019
- Prof Claudiu Supuran per lo screening di inibitori peptidomimetici di Protein Arginine Deaminase 4 (PAD4) e di Anidrasi Carbonica, dal 2012
- Prof. Darren J. Dixon, Oxford University, UK, per lo sviluppo di nuove metodologie di sintesi enantio- e diastereoselettive organo- e metallo-catalizzate, dal 2008
- Prof. Alberto Pupi, Università di Firenze, per lo sviluppo di nuovi traccianti molecolari per imaging PET e SPECT, 2008-2017
- Prof. Antonio Cassone, Istituto Superiore di Sanità, per lo screening di SAP2 (Secreted Aspartyl Protease 2) di Candida albicans con peptidomimetici, 2007-2014
- Prof. Duccio Cavalieri, Università di Firenze, per lo screening di deleti di Saccharomyces cerevisiae con molecole piccole, 2007-2014
- Dr.ssa Donatella Potenza, Università di Milano, per l’analisi conformazionale via NMR di reverse turn modello e peptidomimetici RGD ciclici, 2001-2016
- Prof. Robin J. Leatherbarrow, Imperial College, UK, per la sintesi e analisi conformazionale di peptidomimetici ciclici come inibitori della chimotripsina, 1998-2001
Progetti di ricerca
- Responsabile scientifico del progetto "Sviluppo di inibitori peptidomimetici della proteasi MPro di Sars-CoV-2 come 'direct-acting antivirals' per il trattamento farmacologico delle infezioni da Coronavirus", finanziato da Fondo di Beneficenza Intesa SanPaolo, 2023-2024;
- Partecipante al progetto "GLI-HOPE" - “All Ages Malignant Glioma: Holistic Management in the Personalised Minimally-Invasive Medicine Era – From Lab to Rehab – Work Package 5 “Clinical management and in vitro anthracycyclines effect on chemoresistence of pediatric high-risk gliomas”, Ricerca Finalizzata, 2021-2023
- Partecipante al progetto “Innovative strategy to block coronavirus infections by specific degradation of viral proteins”, Fondo di Beneficenza Intesa SanPaolo, 2022-2023;
- Partecipante al progetto“Synthesis and biomedical applications of tumor targeting peptidomimetics and conjugates” (coord. Prof F. Formaggio, Univ. Padova), finanziato da MIUR PRIN2020, 2021-2024 (36 mesi);
- Responsabile scientifico del progetto “Sviluppo di peptidomimetici inibitori dell'interazione ACE2-proteina Spike S per il trattamento di infezioni da Coronavirus”, finanziato da Fondo di Beneficenza Intesa SanPaolo, 2020-2022;
- Responsabile scientifico del progetto “Synthesis of MMP Inhibitor Constructs for Targeted Anticancer Therapy with Molecular Imaging”, Bando "Giovani@Ricerca Scientifica", finanziato da Fondazione CR Pistoia e Pescia, 2019-2022;
- Responsabile scientifico del progetto “Progettazione e sintesi di inibitori di secretasi coinvolte nella malattia di Alzheimer”, assegno di ricerca dott. Lorenzo Calugi, nell’ambito del progetto “Rete Nazionale di Giovani Ricercatori impegnati nella ricerca sulla Malattia di Alzheimer e sulle altre Demenze”, finanziato da AIRALZH Onlus-COOP Italia, 2019-2020;
- Responsabile scientifico del progetto “Sviluppo di metodiche ‘click’ per la bioconiugazione di molecole piccole e macromolecole con agenti di contrasto T1/T2 e loro caratterizzazione in vitro per MRI”, finanziato da Fondazione CR Firenze, 2018-2020;
- Partner del progetto “MicroPET and microMRI for anti-VEGF response assessment in a murine model of human tumor as a future clinical imaging tool (IMPARA)”, coord. dr.ssa Valentina Berti, finanziato da Università degli Studi di Firenze, Bando di Ateneo per i ricercatori a tempo determinato, 2016-2019
- Partner del progetto “Sviluppo di nuovi inibitori peptidomimetici di beta-secretasi 1 (BACE-1) per il monitoraggio e trattamento di placche amiloidi nel morbo di Alzheimer”, coord. prof Alberto Pupi, Finanziato da Fondazione Cassa di Risparmio di Firenze, Bando Ricerca Scientifica, 2015-2019
- Partecipante al progetto“Tumor-targeting peptidomimetics: synthesis and bio-medical applications” (coord. Prof C. A. Gennari, Univ. Milano), finanziato da MIUR PRIN2015, cod. 20157WW5EH, 2017-2020 (36 mesi);
- Partecipante al progetto“Sintesi e applicazioni biomediche di peptidomimetici in campo oncologico” (coord. prof C. A. Gennari, Univ. Milano), finanziato da MIUR PRIN2010-2011, cod. 2010NRREPL, 2013-2016 (36 mesi);
- Partecipante al progetto“Progettazione, sintesi e marcatura di nuovi ligandi RGD e studi in vitro e in vivo” (prof A. Guarna), finanziato da MIUR PRIN2008, 2010-2012 (24 mesi);
- Partecipante al progetto “Development of new PET tracers for in vivo imaging of integrin alphaVbeta3 expression in melanoma” (prof A. Pupi), relativo al Bando ITT (Istituto Toscano Tumori) per l’assegnazione di fondi per il finanziamento di progetti di ricerca – anno 2008 (36 mesi);
- Partecipante al progetto“Peptidomimetic aspartyl protease inhibitors as innovative therapeutics for HIV and Candida albicans infections” in collaborazione con Università Cattolica del Sacro Cuore e Istituto Superiore di Sanità, (coord. prof R. Cauda, resp. Unità prof A. Guarna), finanziato da Fondazione Roma, 2009-2012 (36 mesi);
- Partecipante al progetto“Sintesi e applicazioni di ligandi delle integrine e loro coniugati” (prof A. Guarna), MIUR PRIN 2006 (24 mesi);
- Partecipante al progetto“Peptidomimetics and Anthrax Therapy” in collaborazione con l’Istituto Superiore di Sanità, (coord. prof A. Cassone, resp. Unità prof A. Guarna), finanziato da ISS-Ministero della Salute, 2005-2007 (24 mesi);
- Partecipante al progetto“Synthesis of RGD-mimetics and their functionalization for imaging studies” nell’ambito del progetto di ricerca “Synthesis, Structural Analysis, and biological evaluation of new Integrins Ligands”, (coord. prof C. Scolastico, Univ. Milano), finanziato da MIUR PRIN 2004 (24 mesi).
Attività Didattica
Docente titolare dei seguenti corsi:
- “Chimica dei Composti Eterociclici” del Corso di Laurea Magistrale in Scienze Chimiche, dal 2024
- “Metodologie di Sintesi di Molecole Bioattive” del Corso di Laurea Magistrale in Biotecnologie Molecolari, dal 2018
- “Drug Discovery” del Corso di Laurea Magistrale in Biotecnologie Molecolari, dal 2013
- “Chimica Organica” del Corso di Laurea triennale in Scienze Biologiche, dal 2012
- “Laboratorio di Metodologie per il Drug Discovery” del Corso di Laurea Magistrale in Biotecnologie Molecolari, per due a.a. dal 2010 al 2012
- “Laboratorio di Chimica Organica I (Corso B)” del Corso di Laurea in Chimica, per tre a.a. dal 2009 al 2012
- “Progettazione e Sintesi di Biomolecole (mod.B)” del Corso di Laurea Specialistica in Biotecnologie Industriali ed Ambientali, per tre a.a. dal 2005 al 2008
- “Laboratorio di Chimica I (II mod.)” del Corso di Laurea in Biotecnologie, a.a. 2005-06
- Ciclo di lezioni intitolate “Peptidomimetics in Organic and Medicinal Chemistry” per gli studenti del Corso di Dottorato di Ricerca in Scienze Chimiche, febbraio 2018
- Ciclo di lezioni intitolate “Diversity Oriented Synthesis” per gli studenti del Corso di Dottorato di Ricerca in Scienze Chimiche, settembre 2016
Tutor di dottorandi: Elena Lenci (ciclo XXIX), Riccardo Innocenti (ciclo XXXII), Lorenzo Baldini (ciclo XXXVI)
Relatore di tesi (dal 2017): laurea triennale (Lorenzo Baldini, Iacopo Passeri, Giulia Favarato, Raffaele Bellini Puglielli, Rachele Cencini, Irene Di Rosa, Martina Feri, Silvia Di Donato), laurea magistrale (Shima Amanollahi, Alessio Rossi, Tommaso Di Francescantonio, Martina Lenzuni, Elisabetta Bucaletti, Lorenzo Baldini, Giulia Sautariello, Filippo Cerullo, Federico Luchi, Antony Chirco, Elisabetta Scalia, Alessio Sanfilippo, Daniele Martinucci, Leonardo Mori);
Tutor per visiting studentship dal 2014 (Vincent Pelizza, Axelle Berrou, Chloé Blino, Dylan Bouetard, Lea Moulet, IUT Rennes, Francia; Fernanda Saldivar, UNAM, Messico; Guillermo del Valle Ribera, Univ. Valencia, Spagna)
Organizzazione, direzione e coordinamento di centri o gruppi di ricerca nazionali e internazionali
- Responsabile scientifico dell’accordo di collaborazione scientifica fra Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff” e Azienda Ospedaliera Universitaria Meyer sul tema “Clinical management and in vitro anthracycyclines effect on chemoresistence of pediatric high risk gliomas”, 2022-2023
- Coordinatore dell’accordo internazionale di cooperazione scientifica e culturale fra Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff” e Istituto di Scienze Chimiche di Rennes (Francia), 2022-2028
- Membro del Centro Interdipartimentale di Ricerca sull'Imaging Molecolare (CIRIB), Università degli Studi di Firenze, dal 2024
- Membro del Consiglio Direttivo del CeSAL, Centro di servizi per la Stabulazione Animali da Laboratorio (CeSAL) dell’Università di Firenze, 2020-2023
- Vice-direttore del Centro Interdipartimentale per lo Sviluppo Preclinico dell'Imaging Molecolare (CISPIM), Università degli Studi di Firenze, 2017-2023
Partecipazione a comitati editoriali di riviste, collane editoriali, enciclopedie e trattati
- Invitato come Guest Editor per lo Special Issue “"Integrins and Tumor Microenvironment, New Perspectives in Targeted Treatments"” per la rivista Cancers, MDPI, 2022
- Invitato come Guest Editor per lo Special Issue “Bioconjugation Strategies in Drug Delivery and Molecular Imaging” per la rivista Molecules, MDPI, 2020,
- Invitato come Guest Editor per il Symposium-in-Print "Design and Synthesis of Bioactive Compounds", special issue della rivista Bioorganic and Medicinal Chemistry, Elsevier, 2017, pubblicati 17 contributi
- Invitato come Guest Editor per lo Special Issue “Diversity-Oriented Synthesis 2016” per la rivista Molecules, MDPI, 2016, pubblicati 4 contributi
- Invitato da Elsevier (US) come Editor del libro “Small Molecules Drug Discovery”, 2019
- Invitato da Wiley (UK) come autore del libro “Peptidomimetics in Organic and Medicinal Chemistry”, 2014
- Invitato da John Wiley & Sons (US) come Editor del libro “Diversity Oriented Synthesis”, 2013
- Traduzione e aggiornamento della II ed. italiana di “Elementi di chimica organica”, P.Y. Bruice, capp 9 e 14, edito da EDISES, 2016
- Incarichi Editoriali attivi
- Incarichi Editoriali precedenti
Partecipazione a enti o istituti di ricerca, esteri e internazionali, di alta qualificazione
- Imperial College of Science, Technology, and Medicine, London (UK): tesi di laurea, correlatore Prof. Robin J. Leatherbarrow, 1998
Premi e riconoscimenti nazionali e internazionali per attività di ricerca;
- 2024: Top Scholar - Prior 5 Years, #45, Drug discovery (ScholarGPS recognizes Top Scholars for their outstanding performance in various Fields, Disciplines, and Specialties. “Your strong publication record, the impact of your work, and the notable quality of your scholarly contributions have placed you in the top 0.5% of all scholars worldwide”); https://scholargps.com/scholars/57944027022458/andrea-trabocchi?e_ref=0f6e2dfab021f5a62407
- 2024: Certificate awarded for Top Downloaded Article, Wiley (paper “Diversity-Oriented Synthesis and Chemoinformatics: A Fruitful Synergy towards Better Chemical Libraries“ was one of the most downloaded during its first 12 months of publication in EUROPEAN JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY, among work published in an issue between 1 January 2022 – 31 December 2022)
- 2022: Certificate awarded for Highly cited author 2021, Royal Society of Chemistry (For publishing research in the top 1% of highly cited works from European institutions)
- 2021: top 10 Special Issue in Medicinal Chemistry Section, Molecules, MDPI
Risultati ottenuti nel trasferimento tecnologico in termini di partecipazione alla creazione di
nuove imprese (spin off), sviluppo, impiego e commercializzazione di brevetti
- Credi, C.; Dallari, C.; Pavone, S.; Innocenti, R.; Trabocchi, A.; Lenci, E. Nanoparticella Raman attiva per spettroscopia SERS, in particolare per la rilevazione di analiti altamente diluiti in campioni liquidi e relativi apparato e metodo per spettroscopia SERS, domanda n. 102022000027336, 30-12-2022; brevetto concesso in data 11-12-2024 ; (estensione PCT: Credi, C.; Dallari, C.; Pavone, S.; Innocenti, R.; Trabocchi, A.; Lenci, E. Raman Active Nanoparticle for SERS Spectroscopy, in Particular for the Detection of Highly Diluted Analytes in Liquid Samples and Related Apparatus and Method for SERS Spectroscopy, WO2024/141910, 4-7-2024)
- Guarna, A.; Trabocchi, A.; Cavalieri, D.; Stefanini, I. Bicyclic peptidomimetics for use in the treatment of fungal infections, domanda n. FI2013A000304, 24-12-2013
- Guarna, A.; Menchi, G.; Cini, N.; Trabocchi, A.; Pupi, A.; Bottoncetti, A.; Raspanti, S.; Calorini, L. 1,2,3-Triazole-Based Peptidomimetic Integrin Inhibitors for the Diagnosis and Therapy of Tumors, WO2011/098603, 18-08-2011
- Guarna, A.; Trabocchi, A.; Cassone, A.; Garaci, E.; De Bernardis, F.; Bicyclic peptidomimetic inhibitors of aspartyl proteases for the treatment of infectious diseases, WO2010/060904, 03-06-2010.
- Guarna, A.; Trabocchi, A.; Menchi, G.; Lalli, C.; Sladojevich, F.; Cini, N. Heterocyclic compounds containing the morpholine nucleus their preparation and use. WO2008/129004, 30-10-2008. Questo brevetto è stato ceduto nel 2009 alla società Minerva Patents SA nell’ambito del processo di trasferimento tecnologico.
Incarichi istituzionali
- Presidente del CdS LM in Biotecnologie Molecolari, Università di Firenze, dal 1 novembre 2022
- Membro della Giunta della Conferenza Nazionale Permanente dei Corsi di Studio in Biotecnologie, da aprile 2023
- Vicedirettore del Centro Interdipartimentale per lo Sviluppo Preclinico dell'Imaging Molecolare (CISPIM), Università degli Studi di Firenze, 2017-2023
- Vicepresidente del CdS LM in Biotecnologie Molecolari, 2018-2022
- Delegato Erasmus per il CdS LM Biotecnologie Molecolari, 2018-2022
- Referente Assicurazione Qualità per il CdS LM Biotecnologie Molecolari, 2018-2022
- Membro della Commissione contatti con esterni (spinoff, innovazione e centri d'eccellenza) e della Commissione didattica del CdS LM Biotecnologie Molecolari, 2015-2022
Altre attività e affiliazioni
- Membro del Consiglio Direttivo di AIRAlzh (dal 2023), https://airalzh.it/consiglio-direttivo/
- Afferente al CIRP, Centro Interuniversitario di Ricerca sulle reazioni Pericicliche e sintesi di sistemi etero e carbociclici
- Afferente al Consorzio Interuniversitario Nazionale CINMPIS “Metodologie e Processi Innovativi di Sintesi”
- Membro dell’European Peptide Society (dal 2021).
- Membro dell’American Chemical Society (dal 2010).
- Membro della Società Chimica Italiana (dal 2001).
- Membro del Comitato Organizzatore e Segretario di 22-ICOS, International Conference on Organic Synthesis, promosso da IUPAC, Firenze, 16-21 Settembre 2018.
- Membro del Comitato Organizzatore di BIOTECH.ORG, Chimica Organica e Biotecnologie: Sfide e Opportunità, Forte dei Marmi (Lucca), 20-23 Maggio 2009.
- Membro del Comitato Organizzatore per la Divisione di Chimica dei Sistemi Biologici del XXII Congresso Nazionale della Società Chimica Italiana, Firenze, 10-15 settembre 2006.
- Membro della commissione giudicatrice per l’esame finale di Dottorato in Chimica, XXXIV ciclo, Università degli Studi di Milano, 2022
- Membro della commissione giudicatrice per l’esame finale di Dottorato in Scienze Farmaceutiche, XXXI ciclo, Università degli Studi di Milano, 2019
- Membro della III commissione giudicatrice per l’esame finale di dottorato in Scienze Chimiche, XXVI ciclo, Scuola di Scienze, Università degli Studi di Firenze, 2014
- Membro della commissione giudicatrice per il premio Molecules 2020 TuYouYou Award, MDPI, 2020
- Revisore per la valutazione dei prodotti della ricerca (VQR 2011-2014) per conto di ANVUR, MIUR, dal 2016
- Revisore per la valutazione dei prodotti della ricerca (VQR 2004-2010) per conto di ANVUR, MIUR, 2012-2014
- Nominato come Referee da European Research Council Executive Agency per la Call ERC Starting Grant 2021
- Revisore internazionale di progetti per Swiss National Science Foundation, 2021
- Membro del DFG (German Research Foundation) expert review panel per National Research Data Infrastructures (NFDI), 2019 e 2024
- Membro dell’Expert Reviewer Team internazionale per la valutazione di progetti per Polish National Science Centre, Polonia, 2019-2022
- Revisore internazionale di progetti per Agence Nationale Recherche, Francia, 2018
- Revisore internazionale di progetti per JSC National Center of Science and Technology Evaluation, Repubblica del Kazakhstan, 2014-2019
- Revisore internazionale di progetti per National Research Council (CNCS) and Executive Agency for Higher Education, Research, Development and Innovation Funding (UEFISCDI), Romania, 2012-2019
- Reviewer per American Chemical Society (Org Lett, J Org Chem, J Am Chem Soc, J Med Chem, ACS Comb Sci, ACS Med Chem Lett dal 2009), Royal Society of Chemistry (Org Biomol Chem, Chem Commun, RSC Adv, Chem Soc Rev, New J Chem, RSC MedChem, dal 2008), Elsevier (Tetrahedron, Tetrahedron Lett, Bioorg Chem, Bioorg Med Chem, Bioorg Med Chem Lett, Drug Discov Today, Eur J Med Chem), Wiley (Angew Chem Int Ed, Eur JOC, Chem Eur J, Chem Asian J, ChemMedChem, Chem Sel, Chem Open, Med Res Rev), MDPI (Molecules, Pharmaceuticals, Intern J Mol Sci), Frontiers (Front Chem), Taylor&Francis (J Enz Inhib Med Chem, Exp Opin Ther Pat, Exp Opin Drug Discov).
- Membro del Reader Panel di Nature Chemical Biology, feb-lug 2010.
Pubblicazioni e comunicazioni a congressi
- >100 Pubblicazioni su rivista, di cui > 50 come autore principale (corresponding author), h-index 26 (Scopus) h-index 29 (Google Scholar)
- 5 brevetti internazionali e nazionali
- 1 libro come autore
- 2 libri come editore
- 5 capitoli di libri
- 1 voce di enciclopedia
- ca. 100 comunicazioni scientifiche a congressi
Interessi di ricerca
Legenda
Andrea Trabocchi is Associate Professor of Organic Chemistry at the Department of Chemistry of the University of Florence and President of the Master's Degree in Molecular Biotechnology. His research interests are in the field of organic synthesis of bioactive heterocycles and peptidomimetic chemistry, with applications in drug discovery in oncology and viral infections. He has been working for years on the identification of inhibitors of enzymes involved in Alzheimer's disease. He is involved in molecular imaging projects, is a member of the University Imaging Center CIRIB and was Deputy Director of the former Interdepartmental Center for Preclinical Development of Molecular Imaging CISPIM (2017-2023). He has been a member of the Board of Directors of AIRAlzh since 2023. He obtained a PhD in Chemical Sciences in 2003 from the University of Florence and received training in peptide chemistry at Imperial College London. He has published > 100 scientific articles and has filed 5 patents. He is also the author of three books, Diversity-Oriented Synthesis (Wiley, 2013), Small Molecule Drug Discovery (Elsevier, 2019), Peptidomimetics in Organic and Medicinal Chemistry (Wiley, 2014). Since February 2023 he is a member of the Advisory board of Chemical Society Reviews, RSC (IF 39).
Andrea Trabocchi, PhD
Associate Professor of Organic Chemistry, University of Florence
Head of MS degree of Molecular Biotechnology
Job Address
Department of Chemistry "Ugo Schiff", Università degli Studi di Firenze
Polo Scientifico e Tecnologico, Via della Lastruccia 13, 50019 Sesto Fiorentino, Florence, ITALY
Phone +39 055 4573507
Education
Specialist in Clinical Biochemistry, University of Rome – Tor Vergata, 2016
PhD in Chemical Sciences, Università degli Studi di Firenze, 2000-2003 (XV Cycle)
Professional qualification as a chemist, 1999
Degree in Chemistry, Università degli Studi di Firenze, 1998
Foreign research experience
Imperial College of Science, Technology, and Medicine, London (UK): degree thesis, tutorship by Prof. Robin J. Leatherbarrow, 1998
Research interests and appointments
Research interests in the field of organic synthesis: Diversity-Oriented Synthesis; solid-phase synthesis; peptidomimetic chemistry; metal-catalyzed C-H activation reactions.
Applications in the field of medicinal chemistry: design and synthesis of enzyme inhibitors and receptor ligands within cancer research, viral infections and in the field of Alzheimer’s disease.
Research activity in the field of molecular imaging: development of new molecular radiotracers for PET/SPECT imaging and of MRI chemical probes within the activities of Interdepartmental Center for Biomedical Imaging (CIRIB).
International scientific collaborations
Dr Andreas Brunschweiger, TU Dortmund University, Germania, for the development and screening of DNA-encoded chemical libraries, since 2021
Dr. Claudia Lalli, Rennes Institute of Chemical Sciences e CNRS, Francia, for heterocyclic chemistry applied to drug discovery, since 2021
Prof Mads Clausen, Technical University of Denmark (DTU), in the field of small molecule and fragment-based drug discovery, since 2019
Prof Stefan Bräse, KIT-Compound Platform (ComPlat), Karlsruhe, Germany, phenotypic screening of DOS chemical libraries, since 2016
Prof. Darren J. Dixon, Oxford University, UK, for the development of new organo- and metal-catalyzed synthetic methods, since 2008
Prof. Robin J. Leatherbarrow, Imperial College, UK, for the synthesis and conformational analysis of cyclic peptidomimetics as chymotrypsin inhibitors, 1998-2001
Representative research programmes
Principal investigator for the project "Development of peptidomimetic inhibitors of Sars-CoV-2 MPro as 'direct-acting antivirals' for the treatment of Coronavirus infections", granted by Fondo di Beneficenza Intesa SanPaolo, apr2023-mar2024;
Partner of the project "GLI-HOPE" - “All Ages Malignant Glioma: Holistic Management in the Personalised Minimally-Invasive Medicine Era – From Lab to Rehab – Work Pachage 5 “Clinical management and in vitro anthracycyclines effect on chemoresistence of pediatric high risk gliomas”, Funded by Ministry of Health, 2021-2023;
Participant to the project “Innovative strategy to block coronavirus infections by specific degradation of viral proteins”, Fondo di Beneficenza Intesa SanPaolo, 2022-2023;
Participant to the project “Synthesis and biomedical applications of tumor targeting peptidomimetics and conjugates” (coord. Prof F. Formaggio, Univ. Padova), finanziato da MIUR PRIN2020, 2021-2024 (36 mesi);
Principal investigator for the project ““Sviluppo di peptidomimetici inibitori dell'interazione ACE2-proteina Spike S per il trattamento di infezioni da Coronavirus”", granted by Fondo di Beneficenza Intesa SanPaolo, 2020-2022;
Principal investigator for the project “Synthesis of MMP Inhibitor Constructs for Targeted Anticancer Therapy with Molecular Imaging”, Bando "Giovani@Ricerca Scientifica", fellowship dr. Elena Lenci, granted by Fondazione CR Pistoia e Pescia, 2019-2021;
Principal investigator for the project “Progettazione e sintesi di inibitori di secretasi coinvolte nella malattia di Alzheimer”, fellowship dott. Lorenzo Calugi, within the project “Rete Nazionale di Giovani Ricercatori impegnati nella ricerca sulla Malattia di Alzheimer e sulle altre Demenze”, granted by AIRALZH Onlus-COOP Italia, 2019-2020;
Principal investigator for the project “Sviluppo di metodiche ‘click’ per la bioconiugazione di molecole piccole e macromolecole con agenti di contrasto T1/T2 e loro caratterizzazione in vitro per MRI”, granted by Fondazione CRF, 2018;
Partner for the project “MicroPET and microMRI for anti-VEGF response assessment in a murine model of human tumor as a future clinical imaging tool (IMPARA)”, coord. dr. Valentina Berti, granted by University of Florence, 2016;
Partner for the project “Development of novel peptidomimetic inhibitors of beta-secretasi 1 (BACE-1) for the diagnosis and treatment of amyloid plaques in the Alzheimer disease”, coord. prof Alberto Pupi, granted by Fondazione CRF, 2015;
Participant to the project“Tumor-targeting peptidomimetics: synthesis and bio-medical applications” (coord. Prof C. A. Gennari) granted by Italian Ministry for Research (MIUR), PRIN2015, cod. 20157WW5EH, 2017-2020;
Participant to the project“Synthesis and biomedical applications of tumor-targeting peptidomimetics” (coord.: C. A. Gennari, research unit resp.: A. Guarna), granted by MIUR PRIN2010-2011, cod. 2010NRREPL, 2013-2016;
Participant to the project“Design, synthesis and labeling of new RGD ligands, and their in vitro and in vivo studies” (A. Guarna), granted by MIUR PRIN2008, 2010-2012.
Participant to the project “Development of new PET tracers for in vivo imaging of integrin alphaVbeta3 expression in melanoma” (A. Pupi), granted by ITT (Istituto Toscano Tumori), 2008.
Participant to the project“Synthesis and applications of integrin ligands and their conjugates” (A. Guarna), granted by MIUR PRIN 2006.
Participant to the project“Peptidomimetic aspartyl protease inhibitors as innovative therapeutics for HIV and Candida albicans infections” in collaboration with Università Cattolica del Sacro Cuore and Istituto Superiore di Sanità, granted by Fondazione Roma, 2009-2012;
Participant to the project“Peptidomimetics and Anthrax Therapy” in collaboration with Istituto Superiore di Sanita and National Institute of Health, 2005-2007;
Participant to the project“Synthesis of RGD-mimetics and their functionalization for imaging studies” within the project “Synthesis, Structural Analysis, and biological evaluation of new Integrins Ligands”, granted by MIUR PRIN 2005-2006.
Teaching activity
Other activities and affiliations
- Guest Editor for the journal Molecules, MDPI, Special Issue “Bioconjugation Strategies in Drug Delivery and Molecular Imaging”, 2020
- Guest Editor for the journal Bioorganic & Medicinal Chemistry, Symposium-in-Print ‘Design and Synthesis of Bioactive Compounds’, 2017
- Guest Editor for the journal Molecules, Special Issue ‘Diversity Oriented Synthesis 2016’, 2016
- Advisory Board member of Chemical Society Reviews, RSC, since 2023
- Associate Editor of the journal Frontiers in Chemistry, Organic Chemistry section, Frontiers, since 2022
- Associate Editor of the journal Diversity Oriented Synthesis, DeGruyter, 2014-2015
- Academic Editor, Editorial Board member of Molecules, MDPI, since 2019
- Review Editor for Frontiers in Chemistry, Frontiers, 2019-2022
- Academic Editor, Editorial Board member of the Journal of Chemistry, Hindawi, since 2012
- Editorial Board member of World Journal of Biological Chemistry, 2011-2013
- Reader Panel member of Nature Chemical Biology, 2010
- Appointed as a reviewer for VQR 2011-2014 by ANVUR, 2016-present
- Appointed as a reviewer for VQR 2004-2010 by ANVUR, 2012-2014
- Appointed as Referee by European Research Council Executive Agency for the Call ERC Starting Grant 2021
- Appointed as external international grant reviewer by Swiss National Science Foundation, 2021
- Member of DFG (German Research Foundation) expert review panel for the Call on National Research Data Infrastructures (NFDI), 2019
- Member of International Expert Reviewer Team appointed by Polish National Science Centre, Poland, 2019-2022
- Appointed as external international grant reviewer by Agence Nationale Recherche, France, 2018
- Appointed as external international grant reviewer by the Rumenian National Research Concil (CNCS) and Executive Agency for Higher Education, Research, Development and Innovation Funding (UEFISCDI), Romania, 2012-present
- Appointed as external international grant reviewer by JSC "National Center of Science and Technology Evaluation", Republic of Kazakhstan, 2014-2015 and 2017
- Reviewer for American Chemical Society (Org Lett, J Org Chem, J Am Chem Soc, J Med Chem, ACS Comb Sci, ACS Med Chem Lett dal 2009), Royal Society of Chemistry (Org Biomol Chem, Chem Commun, RSC Adv, Chem Soc Rev, New J Chem, RSC MedChem, dal 2008), Elsevier (Tetrahedron, Tetrahedron Lett, Bioorg Chem, Bioorg Med Chem, Bioorg Med Chem Lett, Drug Discov Today, Eur J Med Chem), Wiley (Angew Chem Int Ed, Eur JOC, Chem Eur J, Chem Asian J, ChemMedChem, Chem Sel, Chem Open, Med Res Rev), MDPI (Molecules, Pharmaceuticals, Intern J Mol Sci), Frontiers (Front Chem), Taylor&Francis (J Enz Inhib Med Chem, Exp Opin Ther Pat, Exp Opin Drug Discov).
- Member of the American Chemical Society (since 2010), European Peptide Society (2021) and Italian Chemical Society (since 2001)
- Founding member of the spinoff IMADROM S.r.l., 2015-2022
Publications and communications to conferences
>100 papers on peer-review journals (>50 as corresponding author), h-index 26 (Scopus) h-index 30 (Google Scholar)
3 international + 2 national patents
1 book as author (2014)
2 books as editor (2013, 2020)
4 book chapters
1 enciclopedia entry
>100 scientific communications to conferences
Research interests
organic synthesis: synthesis of heterocyclic compounds, peptidomimetics, combinatorial chemistry and Diversity-Oriented Synthesis, Pd-catalyzed C-H activationdrug discovery: enzymatic inhibitors of MMP, BACE-1, 3CLPro; development of PROTACdrug delivery: glycated bioconjugates for the delivery of anticancer drugs for the treatment of glioblastoma (Meyer Children's Hospital, Florence, Iacopo Sardi)nanotechnology: development of functionalized nanoparticles for SERS sensors (in collaboration with LENS, Caterina Credi and Francesco Pavone)molecular imaging: development of ER ligand radiopharmaceuticals for molecular imaging in Alzheimer's disease (IRCCS Policlinico San Martino, Genoa, Gianmario Sambuceti)
